Cota no cuenta con un centro médico de alto nivel, lo que significa que sus habitantes tienen que desplazarse para poder ser atendidos cuando requieren servicios de medicina avanzada, ya sea a Chía o Bogotá, que son los más próximos al municipio. Con el fin de suplir esta falta, el alcalde Orlando Guitarrero incluyó en su plan de gobierno la continuación de la construcción del centro médico, que contaría con equipos avanzados.

​El 8 de noviembre de 2019 se celebró el primer contrato para la construcción de la infraestructura del centro de salud con el consorcio Hospitales de La Sabana. Integrado por Néstor Orlando Miranda Castro, Eficiencia Energética Led de Colombia SAS, Paim De Colombia SAS y Cava Construcciones SAS, con participaciones del 40, 28, 27 y 5 % respectivamente.

El 3 de agosto de 2020 se firmó el acta de inicio a la obra, es decir 10 meses después de haberse firmado el contrato. A partir de esta fecha empezaron a contar los 17 meses de ejecución. Esta primera fase pasó por dos suspensiones, aumentando 176 días a la construcción. También se realizaron dos modificaciones al contrato original y cuatro prórrogas que aumentaron el tiempo de ejecución del contrato a 27 meses aproximadamente, sin contar el periodo transcurrido entre la firma y la ejecución. Con todo lo anterior quedó como fecha de terminación de contrato el 14 de noviembre de 2023.

​Al 20 de noviembre no hay ningún documento anexado que dé por terminado el proceso.

​El presupuesto inicial fue de 9.397 millones de pesos colombianos. Tuvo dos adiciones presupuestales y cerró con un valor final de 12.991 millones.

​El 24 de julio de 2023 se celebró otro contrato para la fase II del mismo centro de salud. Allí quedó consignado que la Unión Temporal Fase II Sur Huila, quienes fueron contratados inicialmente, no realizaron ningún tipo de actividad y cedieron las obligaciones del contrato al Consorcio Fase II Hospital Cota que se integra por Gerpro Ingeniería Sas y Eficiencia Energética Led de Colombia Sas – EFEL SAS, con una participación del 90 y el 10% respectivamente.

En el Sistema Electrónico de Contratación Pública se registra que el proceso tendría un valor de 4.795 millones de pesos colombianos. Por otro lado, en un espacio de rendición de cuentas, la Alcaldía realizó un formato de preguntas y respuestas con la ciudadanía en el que afirmaron que la edificación estaría terminada para diciembre del 2023. Además, se tiene en cuenta que el contrato tiene como fecha de terminación el día 31 del mes ya mencionado.

Al cierre de esta nota, el 22 de febrero de 2024, la construcción seguía en proceso. La nueva Alcaldía comunicó que el proyecto se encuentra suspendido hasta el 1 de abril del presente año. Esta infraestructura tiene un avance del 79.71%, de la totalidad del proyecto. Con lo anterior, se prevé que la finalización de la etapa de construcción se dé durante el mes de octubre y/o noviembre de este año. Pero comentan que no se puede saber con exactitud, cuándo este centro empezara a funcionar.